目前治療分一般性治療、抗病毒治療及中醫中藥治療，這些治療都是必要的。一般性治療事實上是對癥治療，而抗病毒治療是對因治療，中醫中藥治療多通過辨證施治，標本兼治，有效地阻止復發。
　　
　　(1)一般療法
　　
　　①主要是保持局部清潔、干燥及皰壁完整。可每天用等滲生理鹽水清洗，疼痛者可口服止痛藥，給予精神安慰。
　　
　　②并發細菌感染者，可外用抗生素藥膏。
　　
　　③局部疼痛明顯者，可用5%鹽酸利多卡因軟膏或口服止痛藥。
　　
　　④精神安慰，說明復發的原因和如何治療及處理。
　　
　　⑤女性復發性生殖器皰疹須作婦科檢查以除外子宮頸癌。
　　
　　(2)抗病毒藥治療
　　
　　①無環鳥苷被認為是目前最有效的抗HSV藥物。病情嚴重者可靜脈給藥，劑量為每公斤體重5mg，每8小時1次，共5～7天。一般病人可口服，每次200mg，每日4～5次，共7～10天。
　　
　　②三氮唑核苷是一種鳥嘌呤核苷的類似物，有抗DNA和RNA病毒的作用，每天服800mg，共10天，能減輕疼痛和縮短病程。
　　
　　③免疫刺激劑口服左旋咪唑有一定的療效，但有報告效果不太肯定，體外發現干擾素對HSV有抑制作用，臨床治療作用尚在研究中。
　　
　　(3)中醫中藥治療中醫治療主要是根據癥狀、體征，結合舌脈，一般將本病分為三型，即濕熱下注、毒熱蘊結、腎氣不足，分別給予不同的治療方法。