由于生殖器皰疹感染的臨床表現變化多樣，在不同的個體中甚至同一個體的不同發作中，臨床表現都可不相同，因而該病常常需要通過實驗室檢測手段來證實。單純皰疹病毒有兩種類型：單純皰疹病毒 1型和單純皰疹病毒 2型。多數生殖器皰疹是由2型病毒引起，但近年來 1型病毒所致生殖器皰疹增多，約占該病的10%～40%。兩型病毒感染的預后有差別，因此有必要在作病毒檢測的同時進行病毒分型。生殖器皰疹的常用實驗室診斷技術包括以下幾個方面：病毒分離培養和分型這是生殖器皰疹實驗室診斷的“金標準”。通常需時2～4天，可長達14天。臨床標本的來源部位和疾病的病程影響病毒分離培養的敏感性，采用斑丘疹、水皰、膿皰、潰瘍、結痂性皮損作病毒分離培養的標本，其敏感性分別為25%、94%、87%、70%和27%。病毒培養的初步結果可通過免疫學方法(如免疫熒光法、免疫酶法、酶聯免疫吸附試驗等)和分子生物學方法(如DNA限制性內切酶圖譜、DNA探針分子雜交技術)來進行鑒定和病毒分型。通常使用單克隆抗體免疫熒光試驗或酶免疫試驗進行分型，此法精確且簡單。
　　
　　以下是介紹三各快速診斷試驗：
　　
　　1、細胞學檢查：在皮損基底部取標本，用巴氏(Papanicolaou)或瑞特-吉姆薩(Wright-Giemsa，即Tzanck)染色法染色后，于光鏡下觀察，于感染細胞中出現胞漿空泡，細胞融合成多核巨細胞，有時見細胞核內包涵體。這種檢查的敏感性只有抗原檢測法、DNA檢測法或病毒分離培養法的敏感性的50%～70%，而且不具特異性。
　　
　　2、抗原檢測：用免疫學技術檢測病毒抗原是目前最常用的快速診斷方法。這些方法均以特異性抗病毒抗體(單克隆抗體或多克隆抗體，常用單克隆抗體)為基礎，包括直接免疫熒光試驗、免疫酶染色和酶聯免疫吸附試驗(ELISA)。這些方法的敏感性可達病毒分離培養法的70%～90％。但其前提是要選擇質量高、特異性好的試劑。目前，我國醫療市場上應用的病毒抗體的質量和特異性欠佳。
　　
　　3、電子顯微鏡檢查：可顯示水皰或其它皮損中的病毒顆粒，但敏感性低，不到病毒分離培養法的10%，而且不能與其它皰疹病毒相區別。反復發作性尖銳濕疣，久治不愈的衣原體、支原體引起的生殖泌尿系感染及性障礙性疾病、前列腺疾病等引進最先進的技術，中西醫結合，分期治療，綜合治療，取得了很好的療效。

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