大量研究表明導(dǎo)致尖銳濕疣復(fù)發(fā)的因素較多，其中包括一些HPV再感染等因素。
　　
　　1、尖銳濕疣損害和/或HPV未被徹底去除
　　
　　尖銳濕疣損害和/或HPV未被徹底去除是造成尖銳濕疣復(fù)發(fā)的重要因素之一。有學(xué)者發(fā)現(xiàn)尖銳濕疣經(jīng)治療去除疣體后仍有45%的患者存在HPV潛伏感染, 其中67%的患者表現(xiàn)復(fù)發(fā)。這表明HPV未被機(jī)體徹底清除，殘留的尖銳濕疣病變或潛伏HPV感染是尖銳濕疣復(fù)發(fā)的主要原因。作者認(rèn)為在尖銳濕疣治療過(guò)程中每一種外用療法只要仔細(xì)操作，尤其是掌握達(dá)到徹底去除HPV感染的組織范圍和深度則會(huì)大大減少尖銳濕疣復(fù)發(fā)。但在臨床治療過(guò)程中并非都能做到這一點(diǎn)，這與操作者技術(shù)水平有密切的關(guān)系。
　　
　　在前面已敘述HPV感染部位主要在表皮，尖銳濕疣自表皮向外生長(zhǎng)，故無(wú)論是外使用物還是用激光療法等治療，其治療深度應(yīng)達(dá)到表皮基底細(xì)胞層上方，治療范圍應(yīng)超過(guò)尖銳濕疣損害邊緣1～2mm才能將尖銳濕疣病變組織清除干凈。然而，在臨床治療過(guò)程中即便是做到這點(diǎn)，仍有少數(shù)尖銳濕疣患者治療后復(fù)發(fā)。朱文元等研究發(fā)現(xiàn)在少數(shù)尖銳濕疣患者的真皮內(nèi)檢測(cè)到HPV DNA ,這一結(jié)果表明在尖銳濕疣復(fù)發(fā)病例中除了皮膚表皮內(nèi)存在HPV外,真皮內(nèi)存在HPV是尖銳濕疣復(fù)發(fā)的另一重要原因。
　　
　　問(wèn)題是既然HPV是一種嗜表皮的病毒，為什么HPV會(huì)存在于真皮中呢？有幾種可能的解釋?zhuān)?br /> 　　
　　①由于皮膚對(duì)HPV感染的炎癥反應(yīng)，導(dǎo)致HPV DNA的釋放，如炎癥引起基底細(xì)胞液化變性可以導(dǎo)致HPV顆粒釋放到真皮乳頭；
　　
　　②已知艾滋病患者的表皮郎格漢斯細(xì)胞、淋巴細(xì)胞和單核細(xì)胞內(nèi)可以含有HIV，上述細(xì)胞在尖銳濕疣表皮內(nèi)可能吞噬HPV DNA,他們可以從表皮游走到真皮；
　　
　　③HPV病毒血癥導(dǎo)致真皮內(nèi)含有HPV，但由于用免疫學(xué)的方法未能在血清中發(fā)現(xiàn)病毒，故此種可能性極小。
　　
　　2、尖銳濕疣接種感染
　　
　　前面已提到在激光療法和手術(shù)切除療法等治療的過(guò)程中可能將含有HPV的病變組織污染其他部位，如對(duì)尖銳濕疣病變周?chē)瓦h(yuǎn)端皮膚黏膜的接種而發(fā)生尖銳濕疣。
　　
　　3、被HPV污染的物品
　　
　　在尖銳濕疣的傳播途徑中已敘述其間接傳染途徑，這也可能成為尖銳濕疣復(fù)發(fā)因素之一。如患者用過(guò)的被HPV污染的毛巾等未加處理，再次接觸后可造成尖銳濕疣復(fù)發(fā)。Bergeron等觀察還發(fā)現(xiàn)被HPV污染了的內(nèi)褲也是尖銳濕疣復(fù)發(fā)的原因。
　　
　　4、性伴HPV感染或尖銳濕疣存在
　　
　　患者的性伴有HPV感染或尖銳濕疣未徹底治療，患者尖銳濕疣治愈后如再次與其性接觸后就可以引起尖銳濕疣復(fù)發(fā)。
　　
　　5、尖銳濕疣亞臨床表現(xiàn)與HPV潛伏感染
　　
　　尖銳濕疣亞臨床表現(xiàn)與HPV潛伏感染存在是引起尖銳濕疣及其復(fù)發(fā)的最重要的因素。Erpenbach等報(bào)道廣泛黏膜的尖銳濕疣亞臨床表現(xiàn)和HPV潛伏感染可能引起30%~70%尖銳濕疣病例的復(fù)發(fā)。周華等應(yīng)用PCR技術(shù)檢測(cè)發(fā)現(xiàn)在非皮損區(qū)HPV陽(yáng)性者中有37.5%復(fù)發(fā)。
　　
　　6、機(jī)體免疫系統(tǒng)的完整性
　　
　　如前所述尖銳濕疣患者免疫系統(tǒng)發(fā)生變化在尖銳濕疣發(fā)生發(fā)展與消退中起著重要作用。因此，各種內(nèi)外因素引起機(jī)體免疫功能下降，使機(jī)體免疫應(yīng)答的調(diào)節(jié)紊亂，最終導(dǎo)致完整的細(xì)胞免疫系統(tǒng)平衡失調(diào)或缺陷是尖銳濕疣復(fù)發(fā)惡性循環(huán)中的一個(gè)很重要的因素。
　　
　　7、其他
　　
　　引起復(fù)發(fā)的其他因素中有患者個(gè)人不良衛(wèi)生習(xí)慣、男性包皮過(guò)長(zhǎng)、女性各種外陰陰道感染以及其引起的分泌物增多造成局部的潮濕環(huán)境等。