到目前為止，盡管對尖銳濕疣的發病機理尚不十分清楚，但一些研究已對HPV的感染過程，HPV在組織中的存在狀態與增殖，以及尖銳濕疣的發病機理有了較深入的了解。
　　
　　HPV是一種明顯具有宿主和組織特異性的DNA病毒。因此，HPV只能感染人類，人類是HPV的惟一宿主。而且HPV具有嚴格嗜上皮細胞的特點，HPV 侵入機體后，該病毒主要限定于皮膚和粘膜上皮細胞。HPV不進入血液擴散到全身，不產生毒血癥等，也不會引起人體內臟器官尖銳濕疣損害。
　　
　　在動物模型中，皮膚粘膜上皮的損傷是導致HPV感染必需的因素。因此，HPV 進入皮膚粘膜上皮細胞之前首先要有皮膚粘膜的破損。這種破損可能是輕微的，往往用肉眼看不見，也可能是較明顯的損傷。在人體易受HPV感染的部位是外生殖器官，也是在性交過程中皮膚粘膜容易受損傷之處，如在女性的陰道口、后聯合、尿道口和陰道壁，在男性的包皮內側、冠狀溝、系帶等處。此外，肛門也是HPV 感染的好發部位。因此，在性交等過程中外生殖器官和／或肛門的皮膚粘膜只要有微小的損傷時，HPV就有機會進入機體。HPV進入機體皮膚粘膜后，主要潛伏于表皮內基底細胞間，也有個別報告少數病毒在真皮中存在。一旦時機成熟HPV則進人角朊細胞內進行增殖