沙眼衣原體感染與有非常密切的關系。淋病最常伴發沙眼衣原體感染，約有三成的淋病患者合并有沙眼衣原體感染。

　　1） 淋病對衣原體感染起著激活與促進的作用。淋病患者的沙眼衣原體的分離率也明顯高于不合并淋病的人群。實驗研究表明，淋病雙球菌的存在使沙眼衣原體在尿道的復制能力提高100倍。

　　2） 淋病雙球菌還對沙眼衣原體的復發起到加速作用。有人報道，沙眼衣原體感染引起的尿道炎復發者，約半數合并有淋病。

　　3） 此外，無論在淋病治療前，還是治療后，均可檢測出沙眼衣原體，其原因可能是沙眼衣原體感染一方面來源于性伴，或者衣原體感染潛伏期較長。

　　因此，在對淋病患者進行檢驗的同時或淋病治療后仍有癥狀的患者有必要作沙眼衣原體檢測，在淋病治療的同時或治療后仍有癥狀時，應考慮對沙眼衣原體進行治療。