因為淋球菌最易侵犯泌尿生殖器官柱狀上皮與移行上皮形成的粘膜，所以淋菌性尿道炎、前庭腺炎與肛門炎多見；由復層鱗狀上皮構成的陰道粘膜不易被淋球菌侵犯，所以淋球菌陰道炎較少見。其臨床表現如下：
　　
　　（1）淋菌性尿道炎與尿道旁腺炎
　　
　　一般在性交后2～5日出現尿痛、尿急、尿燒灼感等癥狀，尿道口紅腫充血，擠壓尿道旁腺，有膿性分泌物溢出。
　　
　　（2）淋菌性前庭腺炎
　　
　　前庭腺有明顯的紅、腫、熱、痛等急性炎癥反應，嚴重者可形成前庭腺膿腫。
　　
　　（3）淋菌性子宮頸內膜炎
　　
　　子宮頸管內膜為淋球菌最易隱藏之處，患者子宮頸充血、水腫、觸痛，常發現膿性白帶增多。
　　
　　（4）淋菌性盆腔炎
　　
　　系指一組疾病，包括急性輸卵管炎、子宮內膜炎、輸卵管卵巢膿腫、盆腔膿腫及腹膜炎等。多數急性輸卵管炎患者可無癥狀，只是月經周期延長，月經來潮時血量增多，月經過后即可產生高熱、寒顫、頭痛、惡心、嘔吐及食欲不振等；其他癥狀包括：兩下腹部疼痛，有明顯壓痛，一側較重。婦科檢查可見尿道、尿道旁腺、前庭腺及子宮頸處有膿性分泌物，雙側附件增厚、壓痛。如有輸卵管卵巢膿腫，于附件處或子宮后穹窿處觸到腫物，并有觸痛及波動感。如輸卵管膿腫破裂，則可引起腹膜炎，甚至中毒性休克。
　　
　　上述癥狀與體征只能提示為一急性炎癥，沒有特異性，故不能定性。單憑這些癥狀與體征往往不易與急性闌尾炎、異位妊娠、卵巢囊腫扭轉或破裂等婦產科急腹癥相鑒別，還要靠涂片及培養查菌來確定診斷。